Работа по организации санитарно-защитной зоны ТМТП проводилась с 2006 года. В рамках проекта были выполнены необходимые природоохранные мероприятия: угольные площадки вынесены на дальние рубежи причального фронта, установлена система пылеподавления, состоящая из генераторов водяного тумана, построен пылешумозащитный экран высотой 6 метров, проходящий вдоль северо-восточной границы тыловых территорий сухогрузного района ТМТП и северо-восточной границы промплощадки ОАО «Туапсинский судоремонтный завод». Для постоянного контроля качества атмосферного воздуха на производственных площадках порта оборудованы два поста экологического мониторинга.
Дополнительно по заказу ТМТП регулярный мониторинг основных показателей воздействия предприятия на окружающую среду осуществляет аккредитованный специализированный испытательный центр Туапсинского филиала ФБУ «Центр гигиены и эпидемиологии по Краснодарскому краю». Последние результаты исследований, проведенных в III квартале 2015 года, подтвердили отсутствие превышений предельно-допустимых концентраций загрязняющих веществ в атмосферном воздухе в санитарно-защитной зоне порта.
